利用菲兹制作的假身份，梅琳达和芭芭拉进入了大开曼岛一家守卫森严的银行里，取走了亚历克斯藏在保险箱里的十几本假护照，而根据调查，其中一本假护照的名下在葡萄牙里斯本有一座别墅。
通过调取海关的视频，菲兹找到了亚历克斯进入里斯本的画面，紧跟着梅和芭芭拉立刻赶往了葡萄牙。
而在同一时间赶往葡萄牙的，还有沃德的手下，他之所以知道亚历克斯在里斯本，是因为他接到了吉迪恩·马利克的电话，而马利克将亚历克斯的所有信息全部出卖给沃德，而原因在于亚历克斯知道的太多了。
就这样，沃德的新分部，终于同九头蛇残余的其他势力，其他真正的势力联系了起来。
这是因为极为精确的情报，所以沃德的手下早了梅和芭芭拉一步，提前赶到了别墅，控制了亚历克斯，然后对他进行残酷的折磨，而就在进行折磨的途中，梅和芭芭拉赶到了。
经过一番激烈的搏斗，芭芭拉和梅击倒了所有的九头蛇特工，这里面还包括沃德的副手。
然而当芭芭拉回到别墅内的时候，却看见抱着亚历克斯尸体的梅一脸见了鬼的模样。
尽管经历了残酷的折磨，尽管在沃德的副手准备逃离的时候在他腹部狠狠的捅了一刀，但是亚历克斯仍旧保留着最后一口气，跟梅说出了那天爆炸的真相。
梅琳达只不过想要从亚历克斯嘴里问出沃德的踪迹，然而提及沃德，意识已经模糊的亚历克斯说出了这样一番话：“我试图完成沃德交给我的任务，我想要杀了他，我们都围住他了，不知道他会变身……”
事情的开头跟加纳教授告诉给科尔森的没有两样，亚历克斯和两名沃德的手下包围住了加纳教授，他们在地上倒满了汽油，神盾局的特工虽然及时出现，开枪杀死一名九头蛇的特工，但却被另外一名特工给杀死。
然而就在这个时候，加纳教授从后面走了出来，一边走，一边变成了可怖的怪物，就是他打晕了亚历克斯和剩下的那名九头蛇特工，然后点燃了汽油，制造了爆炸。
梅琳达作为现在神盾局的高层领导之一，对于斯凯所说的鞭笞是人类变形之后形成的，而且还能重新变回人类，这一切都符合亚历克斯对加纳教授的描述。
更令梅感到可怕的是，作为神盾局的心理医生，加纳教授同样是神盾局所有被救的变异人的心理医生，而且他同样能够获得其他变异人存在的位置信息，将这一切联系起来，一个明显的事实就逐渐浮现了出来。
安德鲁·加纳博士，她梅琳达的前夫，几次试图复合的前夫，她这一次为了他报仇而来的前夫，竟然是屠杀那么多变异人的凶手鞭笞，梅琳达下意识的看向亚历克斯，略带祈求的说道：“这一切不是真的？”
然而弥留之际的亚历克斯根本没办法回答梅琳达的问题，他就像一只奄奄一息的小兽，满是迷茫的问道：“他究竟是个什么东西？”
“我不知道！”梅琳达也不知道该说什么好，她同样满是迷茫，而此时的亚历克斯终于咽下了最后一口气。
同样感到迷茫的，不仅是梅琳达，还有斯凯，阿方索·麦肯锡和亨特，他们三个看着出现在ATCU秘密基地里和罗莎琳肩并肩的科尔森，脸上同样写满了疑惑不解，这一切究竟是怎么一回事。
查找变异人的任务，科尔森亲自担负起来，他和ATCU的人联手合作，而斯凯的任务就只有一个，那就是寻找鞭笞，而为了执行这一任务，他们将暂时闲置下来的亨特也拉了进来。
他们从头开始梳理这件事情，那天弗莱被抓的事情，只有极少数的人才知道，神盾局这边只有科尔森，阿方索·麦肯锡和斯凯三个人知情，他们三个是绝对不会对外泄露情报的，那么问题只有可能出现在ATCU里。
正是因为鞭笞是ATCU的一员，他才会知道那么多变异人的位置信息，所以斯凯将怀疑的人选锁定在班克斯身上，那天他是唯一在护卫队出发前就先走了的。
班克斯是罗莎琳的副手，他知道他们那天的行车路线，他可以查到ATCU掌握的一切关于异人族的信息。
这个怀疑目标是非常合理的，可能性很大，所以斯凯，阿方索·麦肯锡和亨特立刻对他展开了监视。
然而这边斯凯和阿方索·麦肯锡还在商量着在班克斯的车上安装摄像头的事情，那边亨特就已经贸然出手用冷冻枪击晕了他，这种情况下，斯凯只能先取走班克斯的血液样本，送回到神盾局总部，进行DNA检查。
使用DNA检查是最直接也是最方便的办法，异人族的某些DNA片段，跟人类并不相同，一查就能查出来。
尽管从班克斯的身上没有发现任何有价值的东西，然而他手机上传来的一条短信却引起了斯凯的注意。
“目标正被送往恩德塔克斯。”这是班克斯被冰冻之后，从一个未知号码传过来一条信息。
斯凯立刻在电脑上查出了恩德塔克斯的消息，那是位于盖瑟斯堡的一座实验室，高压镀锌铁丝网，还有虹膜识别，密密麻麻的外围巡逻，守卫森严斯凯三人赶到了恩德塔克斯之后，才发觉事情比他们想象的要棘手得多。
正面闯入是不可能的，那么现在唯一的办法就是利用菲兹新发明的无线探测器进入实验室进行侦查。
与此同时，斯凯接到了西蒙斯打来的电话，最后确认班克斯并没有异人族的DNA，他并不是怪物鞭笞。
就在这个时候，恩德塔克斯实验室的外围突然驶来了一辆白色的大卡车，然后驶入了实验室的内部。
通过探测器传回来的监控画面，斯凯他们发现ATCU的人从大卡车上卸下了一只木箱，木箱被打开，出现在里面的赫然是一直高强度玻璃箱，而在玻璃箱的里面是一名陷入昏迷的变异人。
这就是ATCU的真面目，他们在恩德塔克斯实验室存储他们找到的变异人，就像笼中兽一样，而就在这个时候，斯凯看到了出现在实验室里面，和罗莎琳肩并肩站着的科尔森。
很明显，科尔森对罗莎琳所做的这一切并不感到意外，而且没有反对，他已经接受了这一切。
因为嘉颖的缘故，斯凯自觉对异人族所欠甚多，这也是为什么她始终坚持将神盾局找到的变异人通过凌霄送往一处秘密的异人族聚集地，而不是像科尔森说的那样，组建一支由变异人组成的特战小队。
是的，科尔森曾经提出过要组建一支由变异人组成的特战小队，来应对局势的发展。
从这一点就能看得出，科尔森的野心很大，但是由于斯凯的坚决反对，加上变异人不大愿意为神盾局工作，以及后来发生的鞭笞事件，所以这件事情最后只能不了了之。
斯凯至始至终都觉得自己是异人族的成员，虽然她现在在为神盾局工作，但是看到自己的族人像是野兽一样被关在笼子里，这一点她的心里非常的难受，如果这件事情科尔森不能给她一个合理的解释，那么……
作为异人族的一员来说，这种事情确实很难接受，但是作为人类，科尔森接受起这件事情来所以并没有那么多困难，罗莎琳对他给出了一个很合理的解释。
这些变异人不过是被放在一种冻结胶质里，可以让它们处于静止态，健康鲜活，仅仅是沉睡着而已。
实际上ATCU这么做也是不得已，这些变异人在转化后都很难掌握自己的能力，甚至难以自控，有的人想自残，有的人伤了自己爱的人，他们非常的危险，对自己如此，对其他人同样如此。而ATCU正在研究一种针对变异人的解药，而且就快要找到了，一旦解药要完成，变异人将不再成为威胁。